Profundidade acima de 300x
A elevada quantidade média de leituras aumenta a capacidade de investigar variantes de baixa frequência no exoma nuclear.
Exoma de alta profundidade
Quando uma alteração genética está em apenas parte das células.
O NeoExoma Mosaico usa sequenciamento de alta profundidade para investigar alterações presentes em uma pequena proporção das células. Achados relevantes passam por confirmação específica.
- Território
- Exoma nuclear
- Profundidade
- Média acima de 300x
- Confirmação
- Acima de 2000x*
- Pós-laudo
- Infinity VUS incluído
Por que a profundidade importa
Uma variante em mosaico pode aparecer como um sinal discreto.
No mosaicismo, a alteração surge após a fecundação e não está presente em todas as células. Quanto menor sua proporção na amostra, maior o desafio para diferenciá-la de um artefato técnico.
Validação acima de 2000x
Candidatas relevantes com frequência alélica acima de 5% seguem para PCR e ressequenciamento de alta profundidade.
O tecido faz parte da estratégia
Quando o mosaicismo é restrito, uma amostra clinicamente afetada pode ser mais informativa do que sangue ou swab bucal.
* Confirmação específica para candidatas dentro dos critérios técnicos do exame. A sensibilidade depende da fração alélica, da região, da qualidade e do tecido analisado.
Indicação clínica
Quando considerar o NeoExoma Mosaico?
A hipótese ganha força quando os sinais são segmentares, assimétricos, focais ou restritos a um tecido.
01
Sobrecrescimento segmentar
Macrodactilia, diferença entre membros, crescimento focal ou suspeita de espectro PROS/PIK3CA.
02
Malformações vasculares
Lesões venosas, linfáticas, capilares ou quadros mistos com distribuição localizada.
03
Neurologia focal
Malformações corticais, hemimegalencefalia, epilepsia focal ou achados assimétricos.
04
Síndromes neurocutâneas
Lesões cutâneas segmentares, esclerose tuberosa com teste prévio negativo ou formas focais de doenças mendelianas.
Amostra orientada pelo caso
O tecido analisado pode definir a chance de encontrar o sinal.
Uma variante restrita a pele, vaso, osso ou cérebro pode estar ausente ou abaixo do limite de detecção em sangue ou swab bucal. A coleta de tecido afetado depende de indicação e viabilidade clínica.
O exame investiga
SNVs e pequenos indels no exoma nuclear.
- Variantes germinativas e candidatas em mosaicismo nas regiões codificantes avaliáveis.
- Pequenas inserções e deleções de até 20 pares de bases, conforme escopo técnico.
- Classificação segundo critérios ACMG e ClinGen aplicáveis.
Limites importantes
Nem toda forma de mosaicismo está no alcance.
- CNVs e genoma mitocondrial não fazem parte da análise padrão do NeoExoma Mosaico.
- Regiões não codificantes, pseudogenes, alta homologia e repetições podem não ser adequadamente avaliadas.
- Expansões, inversões e translocações exigem outra metodologia.
- Um resultado negativo em sangue ou swab bucal não exclui uma variante restrita ao tecido afetado.
Acompanhamento pós-laudo
A ciência evolui. A interpretação de uma variante também pode evoluir.
Todos os exames da NeoGenomica incluem o Infinity VUS para as variantes de significado incerto que forem reportadas.
Seu resultado acompanhado ao longo do tempo
Uma variante de significado incerto, ou VUS, é um achado para o qual a evidência disponível ainda não permite concluir se está relacionado à doença. O Infinity VUS monitora atualizações de classificação mesmo depois da emissão do laudo.
-
01 · Monitora
Compara periodicamente as VUS reportadas com novas evidências e classificações.
-
02 · Revisa
Uma mudança relevante é encaminhada para revisão especializada antes de qualquer comunicação.
-
03 · Atualiza
Quando a reclassificação é confirmada e aplicável ao caso, a equipe responsável é comunicada e o laudo pode ser atualizado.
Jornada do exame
Da hipótese à confirmação.
Um fluxo de alta profundidade que começa pela escolha da amostra e termina com interpretação clínica dos achados.
-
01
Discussão da indicação
A hipótese de mosaicismo, o tecido afetado e o VAF esperado orientam a estratégia.
-
02
Definição da amostra
Sangue, swab bucal ou tecido afetado, conforme indicação e viabilidade clínica.
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03
Sequenciamento acima de 300x
O exoma nuclear é analisado em alta profundidade e passa por controle de qualidade.
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04
Confirmação acima de 2000x
Candidatas relevantes dentro dos critérios técnicos são validadas por PCR e ressequenciamento.
-
05
Laudo clínico
O resultado reúne classificação, limites técnicos, contexto da amostra e Infinity VUS.
Dúvidas frequentes
Antes de definir a amostra.
O que é mosaicismo?+
É quando uma variante surge após a concepção e está presente apenas em parte das células. Sua fração na amostra pode ser menor e exigir maior profundidade para investigação.
Qual é a diferença para um exoma convencional?+
O NeoExoma Mosaico usa profundidade média acima de 300x e protocolo de confirmação acima de 2000x para candidatas dentro dos critérios técnicos, aumentando a capacidade de avaliar sinais de baixa frequência.
Qual amostra deve ser enviada?+
Depende da hipótese. Sangue ou swab bucal podem ser adequados quando a variante está nesses tecidos. Em quadros localizados, o tecido afetado pode ser mais informativo, quando sua coleta for indicada e viável.
Um resultado negativo exclui mosaicismo?+
Não necessariamente. A variante pode estar abaixo do limite de detecção, fora das regiões analisadas ou ausente na amostra testada. O resultado deve ser interpretado junto ao fenótipo e ao tecido.
O exame detecta CNVs, expansões e variantes estruturais?+
CNVs não fazem parte da análise padrão. O exame também não é a metodologia de escolha para expansões, inversões, translocações ou regiões não codificantes.
Amostra e indicação
Discuta o caso antes da coleta.
A hipótese, o tecido afetado e a fração alélica esperada orientam a escolha do material e a interpretação do resultado.
Informações do catálogo
Dados técnicos de NeoExoma Mosaico
Estratégia para investigar variantes presentes em baixa proporção na amostra analisada.
- Aplicações
- Doenças raras e hereditárias, Mosaicismo
- Amostras aceitas
- Sangue periférico, Swab bucal, Tecido afetado (preferencial)
- Prazo estimado
- Prazo sob confirmação da equipe técnica.
- Metodologia
- Exoma nuclear com profundidade média acima de 300x e confirmação acima de 2000x por PCR e ressequenciamento para candidatas nos critérios técnicos.
- Escopo analítico
- SNVs e pequenos indels de até 20 pares de bases no exoma nuclear; candidatas relevantes com fração alélica acima de 5% seguem confirmação específica.
- Solicitação médica
- Necessária
Requisitos
Discussão prévia da hipótese, tecido afetado, fração alélica esperada e viabilidade clínica da amostra.
Limitações
CNVs e genoma mitocondrial não integram a análise padrão. Regiões não codificantes, pseudogenes, homologia, repetições, expansões, inversões e translocações exigem outro método.
