Un análisis amplio
Investiga variantes de secuencia, CNV, variantes estructurales y ADN mitocondrial dentro del alcance técnico de WGS.
Genoma rápido en cuidados intensivos
NeoGenoma UTI es un flujo prioritario de secuenciación del genoma completo (WGS) para recién nacidos y niños en estado crítico con sospecha de enfermedad genética, con comunicación coordinada con el equipo que lo atiende.
Informe completo dentro de los 10 días naturales posteriores a la recepción de la muestra y la información clínica necesaria.
Valor clínico
El objetivo es reducir la secuencia fragmentada de pruebas cuando la condición crítica puede tener una causa genética y una respuesta puede apoyar las decisiones de tratamiento, pronóstico y asesoramiento familiar.
Investiga variantes de secuencia, CNV, variantes estructurales y ADN mitocondrial dentro del alcance técnico de WGS.
La activación, recogida, transporte y procesamiento siguen un flujo específico desde el entorno hospitalario.
Las historias clínicas, la evolución clínica y el contacto con el equipo asistente ayudan a priorizar los hallazgos relevantes.
Indicación clínica
En pacientes críticos con sospecha de etiología genética en quienes el momento de la investigación puede influir en el manejo del caso, incluso cuando la presentación es atípica o no apunta a un síndrome específico.
La elegibilidad la determina el equipo asistente. Es necesario investigar en paralelo las infecciones, los traumatismos, la prematuridad y otras causas adquiridas; la presencia de uno de ellos no confirma ni excluye una condición genética.
01
Convulsiones neonatales, encefalopatía, hipotonía severa o regresión rápida sin causa definida.
02
Afectación multiorgánica, shock o evolución severa sin etiología establecida.
03
Miocardiopatías, acidosis refractaria, trastornos metabólicos o inmunodeficiencias graves.
04
Síndromes malformativos o presentaciones complejas que no apuntan a un diagnóstico único.
Directrices y consenso
NSGC recomienda ofrecer pruebas genéticas sin límite de edad. La secuenciación del exoma, la secuenciación del genoma y/o un panel multigénico con más de 25 genes son opciones de primera línea, con una recomendación condicional de secuenciación del exoma o del genoma sobre el panel. La directriz está avalada por la AES.
02 · ACMGEl ACMG recomienda encarecidamente considerar la secuenciación del exoma o del genoma como prueba de primera o segunda línea en pacientes pediátricos con anomalías congénitas de aparición antes del año de edad o retraso en el desarrollo/discapacidad intelectual de aparición antes de los 18 años.
03 · IPCHIPUn consenso multicéntrico de expertos de los centros miembros del IPCHiP recomienda la secuenciación rápida del genoma o del exoma como opción de primera línea en la UCI neonatal, sin excluir las pruebas rápidas dirigidas cuando estén clínicamente indicadas.
04 · AAPLa AAP recomienda la secuenciación del exoma o del genoma como prueba de primera línea en la mayoría de las circunstancias. El algoritmo también considera el microarray cromosómico y adapta la secuencia al método y contexto clínico.
Cómo interpretar: “primera línea” o “primera etapa” describe cuándo una prueba puede ingresar a la estrategia de diagnóstico; no garantiza el diagnóstico ni reemplaza la evaluación clínica, el consejo genético o las pruebas dirigidas indicadas para el caso. Cada elemento abre la publicación original.
Estrategia de análisis
La evolución en la UCI puede sumar signos importantes tras la solicitud. La información fenotípica actualizada le ayuda a priorizar variantes compatibles e interpretar el resultado en el contexto adecuado.
Manifestaciones, exámenes, historia gestacional, evolución e historia familiar guían el análisis; deberán comunicarse nuevos datos relevantes.
El análisis se puede realizar en el paciente y, cuando lo defina el equipo, incluir a uno o ambos padres para aclarar la herencia y priorizar los hallazgos.
Un hallazgo relevante puede apoyar el diagnóstico y el tratamiento. Un resultado negativo o incierto también limita la investigación, pero no excluye una causa genética.
Evidencia brasileña · Proyecto Genomas Raros
Un estudio prospectivo nacional evaluó la secuenciación del genoma en bebés menores de un año ingresados en UCI neonatales o pediátricas en cuatro estados. Se trata de la cohorte sudamericana más grande publicada en este contexto.
João B. Oliveira, autor principal y equipo brasileño
João B. Oliveira, director del laboratorio NeoGenômica, creó y lideró el proyecto y es el autor principal y correspondiente del estudio. El trabajo tiene como primeras autoras a Carolina A. Moreno y Marina de França, con igual aportación, y reúne a un amplio equipo de investigadores y profesionales de los siete hospitales públicos participantes.
La investigación forma parte del Proyecto Genomas Raros, en una alianza público-privada financiada por el Hospital Israelita Albert Einstein y el Ministerio de Salud a través de PROADI-SUS.
39%
32 diagnósticos moleculares confirmados y otros 7 resultados probablemente diagnósticos entre 100 bebés.
81,1%
73 de 90 médicos tratantes consideraron el resultado clínicamente útil.
32,2%
29 de 90 casos tuvieron un impacto informado en el manejo clínico, incluido el apoyo, la vigilancia, los cuidados paliativos o la terapia dirigida.
70%
63 de 90 médicos consideraron el resultado relevante para el asesoramiento familiar.
Primera prueba genética en el 88% de los casos. En 20 de los 32 diagnósticos confirmados, el genoma estableció la etiología sin una hipótesis clínica específica previa o modificó la hipótesis inicial.
Plazo observado en el estudio: mediana de 13 días. El intervalo fue de 7 a 25 días, contando desde la recepción de la muestra hasta el informe. Este dato pertenece al protocolo de investigación y es diferente al plazo actual de NeoGenoma UTI informado en esta página.
Base internacional · Stephen Kingsmore y colaboradores
Los estudios internacionales a continuación han ayudado a establecer la viabilidad, la velocidad de diagnóstico y la utilidad clínica de la secuenciación rápida del genoma en la UCI. Los datos brasileños siguen siendo la referencia más cercana para nuestro contexto asistencial.
Saunders y sus colegas demostraron un análisis preliminar del genoma en aproximadamente 50 horas para respaldar el diagnóstico diferencial en la UCIN. Fue una pequeña prueba de concepto, no un estudio de resultados.
02 · NOCHE1En el ensayo aleatorio con 65 bebés, el 31% del grupo del genoma rápido recibió un diagnóstico en 28 días, en comparación con el 3% con las pruebas convencionales. El estudio finalizó temprano y no tuvo el poder para demostrar diferencias en la mortalidad.
03 · 2018En la cohorte retrospectiva de Farnaes y colegas, 18 de 42 bebés fueron diagnosticados mediante genómica rápida y 13 de 42 tuvieron un cambio de atención asociado con el resultado.
04 · UCIPEn cuatro UCI pediátricas o cardíacas, 79 de 133 pacientes seleccionados recibieron un diagnóstico; 19 de los diagnosticados tuvieron un cambio de manejo intensivo. La selección clínica y el predominio retrospectivo limitan la generalización.
Cómo interpretar: Los porcentajes de diferentes estudios no deben compararse directamente. Los criterios de inclusión, la gravedad, la estrategia familiar, las clases de variantes, la definición de utilidad y el tiempo hasta el resultado varían. Ninguno de estos números garantiza el diagnóstico, el cambio de tratamiento o el beneficio para un paciente individual.
Integración hospitalaria
Las pruebas de detección de recién nacidos, la investigación metabólica, la microbiología, las imágenes y las evaluaciones clínicas siguen siendo esenciales. Los datos genómicos añaden una capa de diagnóstico a la atención multidisciplinaria.
La ciencia evoluciona. La interpretación de una variante también puede evolucionar.
Todos los exámenes NeoGenomica incluyen Infinity VUS para las variantes de significado incierto que se informan.
Una variante de significado incierto, o VUS, es un hallazgo para el cual la evidencia disponible aún no nos permite concluir si está relacionada con la enfermedad. Infinity VUS monitorea las actualizaciones de clasificación incluso después de que se emite el informe.
Compara periódicamente VUS reportados con nuevas evidencias y clasificaciones.
Un cambio material se envía para revisión de expertos antes de cualquier comunicación.
Cuando la reclasificación es confirmada y aplicable al caso, se notifica al equipo responsable y se puede actualizar el informe.
Flujo prioritario
Coordinación dedicada para integrar WGS rápidamente en la rutina del hospital, desde la activación hasta el informe.
El equipo confirma la indicación, recibe datos clínicos y organiza la logística hospitalaria.
El equipo asistente recolecta sangre periférica o hisopos bucales según las indicaciones.
La muestra pasa por una logística dedicada y trazable hasta el laboratorio.
El genoma es secuenciado, procesado y revisado en contacto con el contexto asistencial.
Los hallazgos críticos se analizan cuando corresponde y el informe completo se entrega dentro de los 10 días calendario.*
* Plazo contado tras la recepción de la muestra y la información clínica necesaria.
Preguntas frecuentes
Sí, en indicaciones pediátricas seleccionadas. Las guías profesionales respaldan el exoma o el genoma como pruebas de primera línea, de primer nivel o de uso temprano en escenarios como retraso global del desarrollo, discapacidad intelectual, ciertas anomalías congénitas, epilepsia sin causa clara e hipotonía inexplicable en la UCI neonatal. La recomendación exacta varía según la afección y no significa WGS para todos los pacientes. Ver recomendaciones y fuentes.
Cuando se sospecha una enfermedad genética, una investigación amplia en una corriente prioritaria puede reducir las pruebas secuenciales y proporcionar información adicional para la discusión sobre el tratamiento, el pronóstico y el asesoramiento.
Dentro de los 10 días naturales siguientes a la recepción de la muestra adecuada y la información clínica necesaria. Los hallazgos críticos se pueden discutir con el equipo de asistencia cuando corresponda.
El equipo orienta el uso de sangre periférica o hisopo bucal, documentación, identificación y embalaje. La recogida la puede realizar el equipo del hospital junto a la cama.
No siempre. Dependiendo de la estrategia definida para el caso se puede considerar un análisis individual, dúo o trío. Las muestras parentales pueden ayudar a reconocer nuevas variantes, confirmar la herencia y reducir ambigüedades, pero en sí mismas no amplían el alcance técnico de WGS.
No. Algunas variantes y mecanismos pueden quedar fuera del alcance técnico o del conocimiento actual. El equipo relaciona el informe con la evolución y define si son necesarias otras pruebas, reevaluaciones o futuros reanálisis.
No. WGS complementa la investigación. Los exámenes metabólicos, los exámenes microbiológicos, las imágenes y las evaluaciones clínicas siguen siendo esenciales.
La comunicación se coordina con el médico remitente. El informe completo organiza los hallazgos, la evidencia, los límites y las implicaciones clínicas para su incorporación al expediente médico.
Apoyo hospitalario
Canal directo para que neonatólogos, intensivistas y equipos hospitalarios organicen la derivación, recogida y transporte.
Información del catálogo
Genoma rápido para pacientes críticos con sospecha de condición genética.
Solicitud médica, muestra adecuada, información clínica actualizada y coordinación con el equipo auxiliar neonatal o pediátrico.
No reemplaza el cribado neonatal, la investigación metabólica, la microbiología, las imágenes o la evaluación intensiva. El impacto clínico no está garantizado para todos los pacientes.